Manchmal können Abfälle zwar verwertet werden, aber die Verwertungsanlagen stehen nicht im gemeinsamen Entsorgungsraum, oder sie müssen auf eine bestimmte Art beseitigt werden und die dafür nötigen Anlagen gibt es nur außerhalb des gemeinsamen Entsorgungsraums. Auch dann prüft die SBB, ob der angediente Entsorgungsweg gefahrlos für Mensch und Umwelt ist oder ob die vorgesehene Verwertung sinnvoll ist. In 2024 konnten von den im gemeinsamen Entsorgungsraum erzeugten Abfällen immerhin 1.607 Tsd. t auch im gemeinsamen Entsorgungsraum entsorgt werden.

Eine wichtige Gruppe in den Abfallmengen sind die Bauabfälle. Zu den wichtigsten Bauabfällen gehören die Abfallarten 170106* Bauschutt und 170503* Boden. Ihr Aufkommen schwankte in den letzten drei Jahren zwischen 400 und 530 Tsd. t.

Weil die Abfallmengen an Boden und Bauschutt so groß sind, sind auch die Entsorgungswege für diese Abfälle wichtig. Die Länder Brandenburg und Berlin haben in ihren Abfallwirtschaftsplänen das Ziel festgelegt, möglichst wenig dieser Abfälle zu deponieren und den verwerteten Anteil zu steigern.

Ein besonders gefährlicher Schadstoff ist Asbest. Abfälle, die diesen Schadstoff beinhalten, werden vor allem in drei Abfallarten eingeordnet: In 170601* Dämmmaterial, das Asbest enthält, 170605* asbesthaltige Baustoffe und 170903* sonstige Bau- und Abbruchabfälle, die gefährliche Stoffe enthalten (z.B. Dachpappen und Brandabfälle). Weil Asbest die Ausbreitung von Feuer hemmt, war er bei der Produktion von Baustoffen sehr beliebt und wurde häufig verbaut. Darum fallen immer noch hohe asbesthaltige Abfallmengen an, obwohl der Einsatz von Asbest bereits seit 1993 nicht mehr erlaubt ist.

Dachpappen können wegen ihrer Materialeigenschaften gut als Brennstoff eingesetzt werden. Wenn Dachpappen gesundheitsschädliche Fasern enthalten, nämlich Asbest oder künstliche Mineralfasern, dürfen sie nicht mehr verbrannt werden, weil sonst die gesundheitsschädlichen Fasern freigesetzt werden. Diese Dachpappen müssen deponiert werden.

Ein Teil der im gemeinsamen Entsorgungsraum entsorgten Abfälle stammt aus dem Ausland. Diese Abfälle sind in erster Linie ungefährliche Abfälle. Ein Teil der im gemeinsamen Entsorgungsraum erzeugten Abfälle wird auch zur Entsorgung in andere Staaten exportiert. Diese Menge ist aber deutlich geringer als die importierte Menge.

Knapp die Hälfte der in den gemeinsamen Entsorgungsraum importierten Abfälle stammt aus Polen. Aber auch aus Dänemark, den Niederlanden, Großbritannien und Italien werden hohe Mengen importiert.

Importiert werden Sortierreste und Altholz, um im gemeinsamen Entsorgungsraum zur Energieerzeugung verbrannt zu werden.

Aus dem gemeinsamen Entsorgungsraum werden Abfälle in andere Staaten exportiert. Dabei machen die Exporte in die Niederlande, nach Frankreich, Dänemark und Tschechien fast drei Viertel der exportierten Mengen aus.

Abfälle werden vor allem dann exportiert, wenn im Ausland eine höherwertige Verwertung dieser Abfälle erreicht werden kann, z.B. werden aus Schlämmen von Industrieabwässern anorganische Stoffe zurückgewonnen, aus Asphaltaufbruch der mineralische Anteil recycelt und Holzabfälle in der Spanplattenproduktion genutzt.