Manchmal können Abfälle zwar verwertet werden, aber die Verwertungsanlagen stehen nicht im gemeinsamen Entsorgungsraum, oder sie müssen auf eine bestimmte Art beseitigt werden und die dafür nötigen Anlagen gibt es nur außerhalb des gemeinsamen Entsorgungsraums. Auch dann prüft die SBB, ob der angediente Entsorgungsweg gefahrlos für Mensch und Umwelt ist oder ob die vorgesehene Verwertung sinnvoll ist. In 2025 konnten von den im gemeinsamen Entsorgungsraum erzeugten Abfällen immerhin 1.765 Tsd. t auch im gemeinsamen Entsorgungsraum entsorgt werden.

Eine wichtige Gruppe in den Abfallmengen sind die Bauabfälle. Zu den wichtigsten Bauabfällen gehören die Abfallarten 170106* Bauschutt und 170503* Boden. Ihr Aufkommen schwankt jedes Jahr abhängig von den Mengen, die für Sanierungs- oder Bauprojekte entsorgt werden müssen. Im Jahr 2025 gab es aber noch einen anderen Grund: Seit dem Spätsommer 2024 gilt eine neue Regel, ab wann ein Gemisch aus Boden und Bauschutt noch als Boden unter der Abfallart 170503* eingestuft werden kann und wann das Gemisch als Bauschutt unter der Abfallart 170106* eingestuft werden muss. Diese Regeländerung betraf ausschließlich Berliner Abfälle. Nach der alten Regel wurde ein Gemisch aus Boden und Bauschutt dann der Abfallart 170106* zugeordnet, wenn der Anteil an Bauschutt 10 % oder mehr betrug. Nach der neuen Regel wird ein Gemisch aus Boden und Bauschutt erst dann der Abfallart 170106* zugeordnet, wenn der Anteil an Bauschutt 50 % oder mehr beträgt. Wegen der neuen Regel fiel die Menge an erzeugtem Bauschutt in 2025 auf rund 265 Tsd. t. Die Menge an erzeugtem Boden stieg 2025 auf fast 879 Tsd. t.

Weil die Abfallmengen an Boden und Bauschutt so groß sind, sind auch die Entsorgungswege für diese Abfälle wichtig. Die Länder Brandenburg und Berlin haben in ihren Abfallwirtschaftsplänen das Ziel festgelegt, möglichst wenig dieser Abfälle zu deponieren und den verwerteten Anteil zu steigern.

Ein besonders gefährlicher Schadstoff ist Asbest. Abfälle, die diesen Schadstoff beinhalten, werden vor allem in drei Abfallarten eingeordnet: In 170601* Dämmmaterial, das Asbest enthält, 170605* asbesthaltige Baustoffe und 170903* sonstige Bau- und Abbruchabfälle, die gefährliche Stoffe enthalten (z.B. Dachpappen und Brandabfälle). Weil Asbest die Ausbreitung von Feuer hemmt, war er bei der Produktion von Baustoffen sehr beliebt und wurde häufig verbaut. Darum fallen immer noch hohe asbesthaltige Abfallmengen an, obwohl der Einsatz von Asbest bereits seit 1993 nicht mehr erlaubt ist.

Dachpappen können wegen ihrer Materialeigenschaften gut als Brennstoff eingesetzt werden. Wenn Dachpappen gesundheitsschädliche Fasern enthalten, nämlich Asbest oder künstliche Mineralfasern, dürfen sie nicht mehr verbrannt werden, weil sonst die gesundheitsschädlichen Fasern freigesetzt werden. Diese Dachpappen müssen deponiert werden.

Seit 2018 sollen Lithiumbatterien und -akkumulatoren getrennt erfasst werden. Weil es aber noch keinen eigenen Abfallschlüssel dafür gab, sollten Lithiumbatterien und -akkumulatoren aus Fahrzeugen unter dem Abfallschlüssel 160121* gesammelt werden und Lithiumbatterien und -akkumulatoren aus Elektroaltgeräten unter dem Abfallschlüssel 160215*. Die getrennt erfassten Mengen haben sich in den letzten Jahren erheblich vergrößert. In 2025 wurden insgesamt über 835 t von Lithiumbatterien und -akkumulatoren getrennt erfasst. Zukünftig werden diese Abfälle unter einem eigenen Abfallschlüssel entsorgt. Ab Dezember 2026 werden Lithiumbatterien und -akkumulatoren unter dem Abfallschlüssel 160607* gesammelt.

Ein Teil der im gemeinsamen Entsorgungsraum entsorgten Abfälle stammt aus dem Ausland. Diese Abfälle sind in erster Linie ungefährliche Abfälle. Ein Teil der im gemeinsamen Entsorgungsraum erzeugten Abfälle wird auch zur Entsorgung in andere Staaten exportiert. Diese Menge ist aber deutlich geringer als die importierte Menge.

Fast zwei Drittel der in den gemeinsamen Entsorgungsraum importierten Abfälle stammt aus Polen. Aber auch aus Dänemark, den Niederlanden, Großbritannien und Italien werden hohe Mengen importiert.

Importiert werden Sortierreste und Altholz, um im gemeinsamen Entsorgungsraum zur Energieerzeugung verbrannt zu werden.

Aus dem gemeinsamen Entsorgungsraum werden Abfälle in andere Staaten exportiert. Dabei machen die Exporte nach Polen, Dänemark und die Niederlande zusammen drei Viertel der exportierten Mengen aus.

Abfälle werden vor allem dann exportiert, wenn im Ausland eine höherwertige Verwertung dieser Abfälle erreicht werden kann. Holzabfälle werden zu Holzwerkstoffen verarbeitet wie Bauelementen, Dekorplatten oder Bodenbelägen. Sortierrückstände werden so aufbereitet, dass ein Ausgangsstoff für die Papierherstellung gewonnen wird. Asphaltaufbruch wird thermisch behandelt, so dass der mineralische Anteil wiederverwendet werden kann. Aus Rückständen aus der Abgasreinigung werden Metalle abgetrennt und aus Schlämmen von Industrieabwässern werden anorganische Stoffe zurückgewonnen.